Как установить библиотеку HDF5 на Ubuntu

Убунту 18

В этом руководстве мы проведем вас через процесс установки библиотеки HDF5 в системе Ubuntu. Иерархический формат данных версии 5 (HDF5) — это модель данных, библиотека и формат файлов для хранения и управления данными. Он поддерживает неограниченное количество типов данных и предназначен для гибкого и эффективного ввода-вывода, а также больших объемов и сложных данных.

Чтобы установить библиотеку HDF5 в Ubuntu, вам необходимо включить репозитории исходного кода, обновить списки пакетов, установить инструменты сборки и зависимости, загрузить исходный код HDF5, извлечь архив, настроить сборку, скомпилировать библиотеку и, наконец, установить ее. общесистемный.

Предпосылки

Прежде чем начать, убедитесь, что у вас есть доступ суперпользователя (root) к вашей системе Ubuntu. Вам также потребуется установить пакет build-essential, который включает основные инструменты, необходимые для компиляции программного обеспечения из исходного кода.

Шаг 1. Включение репозиториев исходного кода

Во-первых, вам нужно включить репозитории исходного кода в Ubuntu. Это можно сделать, открыв утилиту «Программное обеспечение и обновления» и проверив параметр «Исходный код» (deb-src).

Шаг 2. Обновление списков пакетов

Откройте окно терминала и обновите списки пакетов для обновлений и установки новых пакетов. Это можно сделать, выполнив следующую команду:

sudo apt-получить обновление

Команда sudo используется для запуска следующей команды с правами суперпользователя. apt-get update используется для повторной синхронизации индексных файлов пакетов из их источников.

Шаг 3: Установка инструментов сборки и зависимостей

Затем установите необходимые инструменты сборки и зависимости, выполнив следующую команду:

sudo apt-get install build-essential sudo apt-get build-dep hdf5

Пакет build-essential включает в себя список пакетов, которые считаются необходимыми для сборки пакетов Ubuntu, включая компилятор gcc, make и другие необходимые инструменты. Команда build-dep устанавливает зависимости сборки для данного пакета, в данном случае hdf5.

Шаг 4: Загрузка исходного кода HDF5

Создайте каталог, в который вы будете загружать и компилировать библиотеку HDF5. Например:

mkdir ~/CD с программным обеспечением ~/Software

Теперь загрузите архив исходного кода HDF5 с официального сайта с помощью команды wget. Для версии 1.8.10 вы можете использовать следующую команду:

wget

Команда wget — это бесплатная утилита для неинтерактивной загрузки файлов из Интернета. Он поддерживает протоколы HTTP, HTTPS и FTP.

Шаг 5: Извлечение архива

После завершения загрузки извлеките загруженный архив с помощью команды tar:

tar -xf hdf5-1.8.10.tar.gz

Команда tar используется для сжатия или извлечения файлов и каталогов. Опция -x указывает tar, что нужно распаковать, а -f указывает файл.

Шаг 6: Сборка и установка HDF5

Перейдите в извлеченный каталог:

cd hdf5-1.8.10/

Далее настройте сборку, запустив скрипт configure:

./настроить

Этот сценарий проверяет вашу систему, чтобы убедиться, что выполнены все необходимые предварительные условия, и подготавливает ее к установке.

Теперь скомпилируйте библиотеку с помощью команды make. Параметр -j9 позволяет выполнять параллельную компиляцию и может быть настроен в зависимости от возможностей вашей системы:

сделать -j9

Наконец, установите скомпилированную библиотеку HDF5 для всей системы, выполнив следующую команду с правами суперпользователя:

судо сделать установить

Команда make install устанавливает программы и библиотеки в каталоги вашей системы.

Удаление библиотеки HDF5

Если вам нужно удалить локально скомпилированную библиотеку HDF5, перейдите в каталог ~/Software/hdf5-1.8.10/ и выполните следующую команду:

sudo сделать удалить

Заключение

Поздравляем! Вы успешно установили библиотеку HDF5 в свою систему Ubuntu. Теперь вы можете начать использовать его для управления данными. Если вам нужна определенная версия библиотеки HDF5, которой нет в репозиториях Ubuntu, рассмотрите возможность использования контейнера Docker со старой версией Ubuntu, поддерживающей нужную версию HDF5.

Помните, что всегда обновляйте свою систему и ее пакеты, чтобы у вас были последние функции и обновления безопасности.

Да, библиотеку HDF5 можно установить в различных дистрибутивах Linux, а не только в Ubuntu. Однако конкретные шаги установки могут различаться в зависимости от дистрибутива. Рекомендуется обратиться к официальной документации или ресурсам сообщества за инструкциями, адаптированными для вашего конкретного дистрибутива.

Библиотека HDF5 обычно используется для научных и инженерных приложений, которые включают большие и сложные наборы данных. Это особенно полезно для таких задач, как хранение данных, обмен данными между различными языками программирования, параллельный ввод-вывод и анализ данных. Он широко используется в таких областях, как астрономия, биоинформатика, моделирование климата и высокопроизводительные вычисления.

Да, библиотека HDF5 предоставляет языковые привязки для нескольких языков программирования, включая Python, Java, Fortran и MATLAB. Эти привязки позволяют вам взаимодействовать с файлами и данными HDF5, используя синтаксис и функции соответствующего языка программирования. Вы можете найти необходимые библиотеки и документацию для каждого языка на веб-сайте HDF Group.

После установки библиотеки HDF5 вы можете проверить ее версию и доступность, выполнив следующую команду в окне терминала:

h5dump -V

Эта команда отобразит номер версии библиотеки HDF5, если она установлена ​​правильно. Если команда не распознана, это может означать, что библиотека не была установлена ​​должным образом.

Да, вы можете обновить или удалить библиотеку HDF5, выполнив те же действия, что и процесс установки. Для обновления загрузите новую версию исходного кода HDF5, извлеките ее, а затем настройте, скомпилируйте и установите, как описано в руководстве. Чтобы удалить, перейдите в каталог, где находится исходный код HDF5, и используйте команду sudo make uninstall, как показано в руководстве.

Похожие записи

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *